根据教育部、财政部等有关文件要求，所有纳入全国研究生招生计划的研究生入学均须缴纳学费。非定向就业全日制学术型硕士研究生的学费标准为每生每年8000元，定向就业学术型硕士研究生按相关规定缴纳学费；非定向就业和定向就业全日制专业学位硕士研究生按相关规定缴纳学费。

华南理工大学对非定向就业全日制硕士研究生设立“学业奖学金”，覆盖面100%，最高额度达每生12000元/年；对全日制硕士研究生（有固定工资收入的除外）设立“国家助学金”，标准为每年6000元/人/年；同时，教育部设有“研究生国家奖学金”，奖励标准为20000元/人。此外，学校还设有各类企业捐赠奖助学金，家庭经济困难研究生可通过申请“学校困难补助”和“校园地国家助学贷款”、担任研究生三助（助教、助研、研管）岗位等方式获得资助完成学业。